菅原 文昭
| 生物学 | 准教授 |
Last Updated :2024/08/30
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論文
- Hagfish genome elucidates vertebrate whole-genome duplication events and their evolutionary consequences.
Daqi Yu; Yandong Ren; Masahiro Uesaka; Alan J S Beavan; Matthieu Muffato; Jieyu Shen; Yongxin Li; Iori Sato; Wenting Wan; James W Clark; Joseph N Keating; Emily M Carlisle; Richard P Dearden; Sam Giles; Emma Randle; Robert S Sansom; Roberto Feuda; James F Fleming; Fumiaki Sugahara; Carla Cummins; Mateus Patricio; Wasiu Akanni; Salvatore D'Aniello; Cristiano Bertolucci; Naoki Irie; Cantas Alev; Guojun Sheng; Alex de Mendoza; Ignacio Maeso; Manuel Irimia; Bastian Fromm; Kevin J Peterson; Sabyasachi Das; Masayuki Hirano; Jonathan P Rast; Max D Cooper; Jordi Paps; Davide Pisani; Shigeru Kuratani; Fergal J Martin; Wen Wang; Philip C J Donoghue; Yong E Zhang; Juan Pascual-Anaya
Nature ecology & evolution, 2024年01月, ［査読有り］ - Comparative analysis of Hmx expression and the distribution of neuronal somata in the trigeminal ganglion in lamprey and shark: insights into the homology of the trigeminal nerve branches and the evolutionary origin of the vertebrate jaw
Motoki Tamura; Ryota Ishikawa; Yuki Nakanishi; Juan Pascual-Anaya; Makiko Fukui; Takashi Saitou; Fumiaki Sugahara; Filippo M. Rijli; Shigeru Kuratani; Daichi G. Suzuki; Yasunori Murakami
Zoological Letters, 2023年12月, ［査読有り］ - Ultrastructure of the lamprey head mesoderm reveals evolution of the vertebrate head
Takayuki Onai; Noritaka Adachi; Hidetoshi Urakubo; Fumiaki Sugahara; Toshihiro Aramaki; Mami Matsumoto; Nobuhiko Ohno
iScience, 2023年11月, ［査読有り］ - High-quality total RNA extraction from early-stage lamprey embryos
Fumiaki Sugahara; Juan Pascual-Anaya
BioTechniques, 2023年05月, ［査読有り］
筆頭著者 - Evolutionary origin of vertebrate OCT4/POU5 functions in supporting pluripotency.
Woranop Sukparangsi; Elena Morganti; Molly Lowndes; Hélène Mayeur; Melanie Weisser; Fella Hammachi; Hanna Peradziryi; Fabian Roske; Jurriaan Hölzenspies; Alessandra Livigni; Benoit Gilbert Godard; Fumiaki Sugahara; Shigeru Kuratani; Guillermo Montoya; Stephen R Frankenberg; Sylvie Mazan; Joshua M Brickman
Nature communications, 2022年09月 - Thyroid and endostyle development in cyclostomes provides new insights into the evolutionary history of vertebrates.
Wataru Takagi; Fumiaki Sugahara; Shinnosuke Higuchi; Rie Kusakabe; Juan Pascual-Anaya; Iori Sato; Yasuhiro Oisi; Nobuhiro Ogawa; Hiroshi Miyanishi; Noritaka Adachi; Susumu Hyodo; Shigeru Kuratani
BMC biology, 2022年04月 - 小脳の起源と進化を円口類の比較発生から探る
菅原文昭; 村上安則
兵庫医科大学医学会雑誌, 2022年03月 - Forebrain Architecture and Development in Cyclostomes, with Reference to the Early Morphology and Evolution of the Vertebrate Head.
Fumiaki Sugahara; Yasunori Murakami; Juan Pascual-Anaya; Shigeru Kuratani
Brain, behavior and evolution, 2021年09月, ［査読有り］
筆頭著者 - Genetic Mechanism for the Cyclostome Cerebellar Neurons Reveals Early Evolution of the Vertebrate Cerebellum.
Fumiaki Sugahara; Juan Pascual-Anaya; Shigehiro Kuraku; Shigeru Kuratani; Yasunori Murakami
Frontiers in cell and developmental biology, 2021年, ［査読有り］
筆頭著者 - FGF- and SHH-based molecular signals regulate barbel and craniofacial development in catfish.
Itoyama T; Fukui M; Kawaguchi M; Kaneko S; Sugahara F; Murakami Y
Zoological letters, 2019年06月, ［査読有り］ - ヌタウナギ， ヤツメウナギの内耳発生から見えてきた脊椎動物の半規管の進化
菅原文昭; 樋口真之輔
兵庫医科大学医学会雑誌, 2019年03月, ［招待有り］ - Inner ear development in cyclostomes and evolution of the vertebrate semicircular canals.
Higuchi S; Sugahara F; Pascual-Anaya J; Takagi W; Oisi Y; Kuratani S
Nature, 2019年01月, ［査読有り］ - Hagfish and lamprey Hox genes reveal conservation of temporal colinearity in vertebrates
Juan Pascual-Anaya; Iori Sato; Fumiaki Sugahara; Shinnosuke Higuchi; Jordi Paps; Yandong Ren; Wataru Takagi; Adrián Ruiz-Villalba; Kinya G. Ota; Wen Wang; Shigeru Kuratani
Nature Ecology and Evolution, 2018年05月, ［査読有り］ - Expansions, diversification, and interindividual copy number variations of AID/APOBEC family cytidine deaminase genes in lampreys
Stephen J. Holland; Lesley M. Berghuis; Justin J. King; Lakshminarayan M. Iyer; Katarzyna Sikora; Heather Fifield; Sarah Peter; Emma M. Quinlan; Fumiaki Sugahara; Prashant Shingate; Inês Trancoso; Norimasa Iwanami; Elena Temereva; Christine Strohmeier; Shigeru Kuratani; Byrappa Venkatesh; Guillaume Evanno; L. Aravind; Michael Schorpp; Mani Larijani; Thomas Boehm
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018年04月, ［査読有り］ - 円口類から探る、脊椎動物の脳の共通発生プランと進化
菅原 文昭
兵庫医科大学医学会雑誌, 2017年09月, ［招待有り］ - Reconstructing the ancestral vertebrate brain
Fumiaki Sugahara; Yasunori Murakami; Juan Pascual-Anaya; Shigeru Kuratani
DEVELOPMENT GROWTH & DIFFERENTIATION, 2017年05月, ［査読有り］ - Developmental origin of the clavicle, and its implications for the evolution of the neck and the paired appendages in vertebrates
Hiroshi Nagashima; Fumiaki Sugahara; Keisuke Watanabe; Masahiro Shibata; Akina Chiba; Noboru Sato
JOURNAL OF ANATOMY, 2016年10月, ［査読有り］ - On the Vagal Cardiac Nerves, with Special Reference to the Early Evolution of the Head-Trunk Interface
Hiroki Higashiyama; Tatsuya Hirasawa; Yasuhiro Oisi; Fumiaki Sugahara; Susumu Hyodo; Yoshiakira Kanai; Shigeru Kuratani
JOURNAL OF MORPHOLOGY, 2016年09月, ［査読有り］ - Evidence from cyclostomes for complex regionalization of the ancestral vertebrate brain.
Fumiaki Sugahara; Juan Pascual-Anaya; Yasuhiro Oisi; Shigehiro Kuraku; Shin-ichi Aota; Noritaka Adachi; Wataru Takagi; Tamami Hirai; Noboru Sato; Yasunori Murakami; Shigeru Kuratani
Nature, 2016年03月, ［査読有り］ - Reevaluating Emx gene phylogeny: homopolymeric amino acid tracts as a potential factor obscuring orthology signals in cyclostome genes.
Miyuki Noro; Fumiaki Sugahara; Shigehiro Kuraku
BMC evolutionary biology, 2015年05月, ［査読有り］ - On the Homology of the Shoulder Girdle in Turtles
Hiroshi Nagashima; Fumiaki Sugahara; Masaki Takechi; Noboru Sato; Shigeru Kuratani
JOURNAL OF EXPERIMENTAL ZOOLOGY PART B-MOLECULAR AND DEVELOPMENTAL EVOLUTION, 2015年05月, ［査読有り］ - Gene expression analysis of lamprey embryos
Fumiaki Sugahara; Yasunori Murakami; Shigeru Kuratani
In Situ Hybridization Methods, 2015年02月, ［査読有り］ - Origin of the unique morphology of the shoulder girdle in turtles
Hiroshi Nagashima; Tatsuya Hirasawa; Fumiaki Sugahara; Masaki Takechi; Ryo Usuda; Noboru Sato; Shigeru Kuratani
JOURNAL OF ANATOMY, 2013年12月, ［査読有り］ - Evolution of the regionalization and patterning of the vertebrate telencephalon: What can we learn from cyclostomes?
Fumiaki Sugahara; Yasunori Murakami; Noritaka Adachi; Shigeru Kuratani
Current Opinion in Genetics and Development, 2013年08月, ［査読有り］ - Body wall development in lamprey and a new perspective on the origin of vertebrate paired fins
Frank J. Tulenko; David W. McCauley; Ethan L. MacKenzie; Sylvie Mazan; Shigeru Kuratani; Fumiaki Sugahara; Rie Kusakabe; Ann C. Burke
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2013年07月, ［査読有り］ - Developmental and evolutionary significance of the mandibular arch and prechordal/premandibular cranium in vertebrates: revising the heterotopy scenario of gnathostome jaw evolution
Shigeru Kuratani; Noritaka Adachi; Naoyuki Wada; Yasuhiro Oisi; Fumiaki Sugahara
JOURNAL OF ANATOMY, 2013年01月, ［査読有り］ - Involvement of Hedgehog and FGF signalling in the lamprey telencephalon: evolution of regionalization and dorsoventral patterning of the vertebrate forebrain.
Fumiaki Sugahara; Shin-ichi Aota; Shigehiro Kuraku; Yasunori Murakami; Yoko Takio-Ogawa; Shigeki Hirano; Shigeru Kuratani
Development (Cambridge, England), 2011年03月, ［査読有り］ - Evolution of oropharyngeal patterning mechanisms involving Dlx and endothelins in vertebrates.
Shigehiro Kuraku; Yoko Takio; Fumiaki Sugahara; Masaki Takechi; Shigeru Kuratani
Developmental biology, 2010年05月, ［査読有り］ - Evolution of the Turtle Body Plan by the Folding and Creation of New Muscle Connections
Hiroshi Nagashima; Fumiaki Sugahara; Masaki Takechi; Rolf Ericsson; Yoshie Kawashima-Ohya; Yuichi Narita; Shigeru Kuratani
SCIENCE, 2009年07月, ［査読有り］ - A new evolutionary scenario for the vertebrate jaw
Y Shigetani; F Sugahara; S Kuratani
BIOESSAYS, 2005年03月, ［査読有り］ - Heterotopic shift of epithelial-mesenchymal interactions in vertebrate jaw evolution
Y Shigetani; F Sugahara; Y Kawakami; Y Murakami; S Hirano; S Kuratani
SCIENCE, 2002年05月, ［査読有り］ - Compartments in the lamprey embryonic brain as revealed by regulatory gene expression and the distribution of reticulospinal neurons
Y Murakami; M Ogasawara; P Satoh; F Sugahara; M Myojin; S Hirano; S Kuratani
BRAIN RESEARCH BULLETIN, 2002年02月, ［査読有り］ - Identification and expression of the lamprey Pax6 gene: evolutionary origin of the segmented brain of vertebrates
Y Murakami; M Ogasawara; F Sugahara; S Hirano; N Satoh; S Kuratani
DEVELOPMENT, 2001年09月 - Isolation of Dlx and Emx gene cognates in an agnathan species, Lampetra japonica, and their expression patterns during embryonic and larval development: Conserved and diversified regulatory patterns of homeobox genes in vertebrate head evolution
M Myojin; T Ueki; F Sugahara; Y Murakami; Y Shigetani; S Aizawa; S Hirano; S Kuratani
JOURNAL OF EXPERIMENTAL ZOOLOGY, 2001年04月, ［査読有り］
MISC
書籍等出版物
- 生物の科学 遺伝 2024年7月号
上坂将弘; 菅原文昭; 倉谷滋; フアン・パスクァル・アナヤ, 共著, 円口類ヌタウナギと脊椎動物初期進化における全ゲノム重複
2024年06月
9784860438678 - 【月刊「細胞」 2024年5月号】実験生物学で迫る動物の起源と進化
菅原文昭; 村上安則, 分担執筆, 円口類から探る小脳の発生学的起源と進化
ニューサイエンス社, 2024年04月 - 【Clinical Neuroscience 2023年12月号】脳の進化―多様性と可能性
菅原文昭, 分担執筆, 無顎類の神経系―ヌタウナギ，ヤツメウナギの神経系の特徴と進化の過程
中外医学社, 2023年12月 - Handbook of Marine Model Organisms in Experimental Biology: Established and Emerging
Fumiaki Sugahara, 分担執筆, 22. Cyclostomes (Lamprey and Hagfish)
CRC Press, 2021年12月
036744447X - Cerebellum as a CNS Hub (Contemporary Clinical Neuroscience)
Yasunori Murakami; Fumiaki Sugahara, 分担執筆, Evolutionary and Developmental Perspectives on the Origin and Diversification of the Vertebrate Cerebellum
Springer, 2021年11月
3030758168 - In Situ Hybridization Methods (Neuromethods)
Fumiaki Sugahara; Yasunori Murakami; Shigeru Kuratani; Giselbert Hauptmann, 分担執筆, Part IV, "Gene Expression Analysis of Lamprey Embryos"
Humana Press, 2015年02月
1493923021
担当経験のある科目_授業
共同研究・競争的資金等の研究課題
社会貢献活動
メディア報道
- Interview: 脊椎動物の「脳」の基本構造は５億年以上前に成立していた！
大学受験予備校・四谷学院の学部学科がわかる本|公式サイト, 2023年11月 - 理研・東大・兵庫医科大、ヤツメウナギの内柱がヤツメウナギ現生種の系統で独自に獲得された可能性を明らかに
日本経済新聞社, 日本経済新聞, 2022年04月01日, 新聞・雑誌 - 理研・神戸大・兵庫医科大・東大、脊椎動物の３つの半規管の構成要素の大部分が5億年以上前に獲得されていたことを解明
日本経済新聞社, 日本経済新聞, 2018年12月06日, 新聞・雑誌 - 脳の進化的起源を解明
日本工業新聞, フジサンケイビジネスアイ, FBi. Science View, 2016年03月17日, 新聞・雑誌 - 脳の基本構造 5億年以上前に 理研など特定
産経新聞社, 産経新聞, 2016年2月16日朝刊, 2016年02月16日, 新聞・雑誌 - 脳の基本形5億年以上前に 理研と兵庫医大 原始的脊椎動物を解析
神戸新聞社, 神戸新聞, 2016年2月16日朝刊, 2016年02月, 新聞・雑誌 - 脊椎動物の脳基本構造 5億年以上前に完成
日本経済新聞社, 日経産業新聞〔日経テレコン21〕, 2016年2月16日朝刊, 2016年02月, 新聞・雑誌 - 脊椎動物 脳の基本構造 5億年前に完成
日本経済新聞社, 日本経済新聞, 2016年2月16日朝刊, 2016年02月, 新聞・雑誌 - 脳の基本構造 5億年前から
朝日新聞社, 朝日新聞, 2016年2月16日朝刊, 2016年02月, 新聞・雑誌
